Hola! Estoy desarrollando algunos Temas para WordPress y pues necesitaba hacer un tema desde 0 (desde cero) normalmente solía modificar algún tema (en especial los temas de wpgpl, ya que son free).
En este post recopilaré información con respecto al tema que iré creando, ya cuando el tema esté creado lo haré público (pero sólo su versión free, aun que quizá se me ocurra publicar todo el tema), en fin estuve echándole ojo a los temas de woothemes y otros temas premium y son excelentes! Lo malo es que son de paga! pero vamos! quien no pagaría por la calidad de un tema premium! bueno yo no pagaría 
(ya que puedo desarrollar uno …)
Aquí la documentación necesaria (lamentablemente está en inglés), copia y pega las urls en tu navegador (hoy amanecí con flojeritis aguda …)
- http://codex.wordpress.org/Theme_Development
- http://codex.wordpress.org/WordPress_Coding_Standards
- http://yoast.com/wordpress-theme-anatomy/
- http://www.wordpressmax.com/
Si te gustaría tener WordPress como un CMS mas no como blog, este tutorial puede ser de tu interés
- http://codex.wordpress.org/Creating_a_Static_Front_Page
Para las páginas de error
- http://codex.wordpress.org/Creating_an_Error_404_Page
Aquí podrás conocer mas acerca de las funciones de WordPress
- http://codex.wordpress.org/Function_Reference
- http://www.dbswebsite.com/design/wordpress-reference/V3/
Y bueno, si estos enlaces no te bastan, tienes a Google …
Por cierto, estoy en la mira de dedicarme en profundidad a hacer desarrollo web sobre wordpress y actualmente tengo un dominio registrado que aun no tiene contenido en el cual pienso poner toda la información necesaria sobre ello y quizá publicar ahí algunos themes o plugins que vaya creando … ya mas adelante les diré el dominio, aun que quizá ya sepan cual es! salu2
